国立東京多磨大学附属中学・高等学校。通称『たまふ』。この高校では「特別進学科」に超能力者が集められ、国家が管理しているという噂があった。オレは、そんな都市伝説を確かめるために、この学校に入学した。このことはオレの人生にとってすごく重要なことだと思っているのだ。だが、調査を始めたオレはある女子生徒と知り合うことになる。「き、君には……。オレが見えてる……の？」「見えるわよ。　……透明人間さん！」普通じゃない能力を持った少年少女達による、超能力スクールライフが始まる。